Начало статьи про геномную оценку молочных животных вы можете прочитать тут:
Геномная оценка включает в себя 40000 генетических маркеров – «снипов» на каждое животное. Точнее, одновременно с помощью ДНК-чипа генотипируют 58000 маркеров, из них около 40000 считают информативными, имеющими влияние на признаки, интересующие селекционеров. Генетические маркеры, используемые в геномной оценке, покрывают все хромосомы и учитывают передачу по наследству всех участков генома. Каждый из них оказывает разное действие на признак от большого до самого незначительного эффекта. Однако сумма самых небольших эффектов является существенной для проявления признака. Именно поэтому и учитывают в геномной оценке все 40000 однонуклеотидных замен.
Геномная оценка решает одновременно в одной пробе ДНК широкий спектр задач – определение достоверности происхождения, степени родства и генетической гетерогенности, выявление генетических аномалий, улучшение продуктивных признаков, повышение устойчивости к заболеваниям. Например, в новой системе геномной оценки за вопросы достоверности происхождения будут отвечать 94 маркера – SNP. В настоящее время в большинстве стран мира, генетическая экспертиза проводится в среднем по 11-13 микросателлитным локусам.
Таким образом, новая геномная оценка имеет ряд принципиальных преимуществ в сравнении с традиционной генетической:
- Использование большого количества маркеров — SNP, одновременный анализ всех участков генома, суммарный учет малых влияний. Селекция, основанная на геномной оценке, осуществляется не по отдельным : «главным генам», а по всему геному.
- До настоящего времени генетические маркеры сопоставлялись с одним-двумя признаками. По отношению к общей зоотехнической оценке животных, которая включает много параметров, такой подход сравним с селекцией по «выдернутому» признаку. В новой геномной оценке одновременно учитываются 26 основных зоотехнических признаков, плюс 27-й – экономическая значимость.
- Повышается точность оценки племенной ценности быков. В начале проводятся исследования по маточному поголовью, вслед за этим проводится оценка быков-производителей. Например, если определенная группа SNP встречается у коров с высоким содержанием белка в молоке, то они могут быть ассоциированы с высокой белковомолочностью. Наличие этой группы SNP у животного может свидетельствовать о высоком значении GPTA по показателю белковомолочности. Знание последовательности ДНК отца и матери позволяет прогнозировать, какие именно участки генома и наследственные задатки может получить потомок. Согласно данным голштинской и джерсейской ассоциации, дополнение геномной информации к традиционным методам оценки увеличивает достоверность оценки быков по всем показателям, а накопление данных приводит к увеличению точности «геномного прогноза».
- Возможность ранней оценки быков и соответственно ускоренное их использование. Сразу после рождения можно установить, какие именно участки генома унаследовало данное животное и, используя имеющуюся в наличии информацию о геноме и происхождении, дать первый прогноз, который уточняется по мере роста и развития животного и получения первых потомков. По данным зарубежных ученых, это позволяет ускорить генетический прогресс молочных стад на 50% за счет повышения интервала между поколениями.
Геномная прогнозируемая племенная ценность (GPTA) – это геномный прогноз по всем основным генетическим параметрам: молочной продуктивности, показателям здоровья, долголетия, воспроизводства, по признакам типа. GPTA вычисляется на основе: прямого анализа ДНК, определяющего наследование важных функциональных генов данным животным; собственных индивидуальных показателей; информации о происхождении и о качестве потомства.
Символ «G» над именем животного в генетических сертификатах, свидетельствует, что оно было генотипировано. Если «G» следует за номером предка, значит, он тоже генотипирован.
Использование геномной информации в расчете племенной ценности отражается и в официальных племенных документах аббревиатурой GPTA, а для типовой оценки – GPTAТ на том месте, где ранее располагалось обозначение традиционной оценки (Predicted Transmitting Abilitu).
Необходимо также проведение геномной оценки для подбора доноров эмбрионов — матерей быков. Опираясь на данные геномной оценки, селекционер может на самом высоком качественном уровне решить задачу подбора родительских пар, чтобы получить потомков, несущих комбинацию желательных участков генома и, соответственно, желательных признаков.
Геномная оценка уже используется в США, Канаде, Нидерландах, Новой Зеландии, во Франции, в Дании, Италии, Австралии, Германии и др.
Немецкий союз заводчиков голштинской породы (DHV) обладает самым большим в мире «тренировочным пулом» (сведениях о быках, оцененных по продуктивности дочерей и протестированных геномно.
Еще с августа месяца 2011 года геномная селекция стала официальным методом племенной оценки симментальской породы в Германии и Австрии.
Совершенно очевидно, что на международном уровне геномная оценка есть официальным методом отбора качественного генетического материала для селекционной работы в хозяйстве.
К сожалению, в Украине, наличие объективных причин (отсутствие современного высокопроизводительного оборудования, доступных по цене отечественных тест систем и расходных материалов) и субъективных (отсутствие высококвалифицированных специалистов и, в ряде случаев, недопонимание важности постановки вопроса) является сдерживающим фактором в проведении широкомасштабных геномных исследований.
Уже сегодня закупки генетического материала для племенного племенного поголовья за рубежом следует проводить с учетом результатов геномной оценки.
Именно поэтому ТОВ «Зоотехцентр» наладил сотрудничество с лучшим поставщиком качественного генетического материала в Европе – с компанией German Genetics Inernational GmbH (GGI). И на сегодняшний день мы представляем вам каталог самых актуальных пород для разведения:
Особую актуальность данная проблема приобретает для устойчивого экономического развития и возрождения загрязненных радионуклидами территорий. Речь идет не только о научном престиже, но и продовольственной безопасности страны, ибо продовольствие является и в будущем станет важнейшим стратегическим ресурсом страны.